Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPBO95292 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPBO95292 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPBO95292 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms