Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP19O94966 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP19O94966 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP19O94966 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms