Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRMUO75648 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms