Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms