Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPNO60542 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPNO60542 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms