Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNCRIPO60506 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms