Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms