Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRXO43186 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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