Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGSM2O43147 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms