Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGFO15240 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGFO15240 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGFO15240 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VGFO15240 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VGFO15240 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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