Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNMO15061 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNMO15061 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SYNMO15061 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNMO15061 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNMO15061 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNMO15061 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms