Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms