Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL9O00512 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCL9O00512 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCL9O00512 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCL9O00512 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCL9O00512 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCL9O00512 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCL9O00512 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCL9O00512 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms