Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DFFAO00273 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms