Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms