Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM25CB3EWG5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms