Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HACD1B0YJ81 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms