Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms