Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2L3Q9Y4A8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms