Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms