Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms