Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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