Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP68Q9UHB9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms