Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5BQ9UGL1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms