Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT172Q9UG01 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms