Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms