Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms