Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC17A6Q9P2U8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms