Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms