Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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