Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms