Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms