Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms