Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAK1IP1Q9NWT1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms