Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLE1Q9NVX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms