Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINM1Q9NU53 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms