Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEPPQ9NTK1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms