Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms