Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms