Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FANCFQ9NPI8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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