Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IL1RAPQ9NPH3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IL1RAPQ9NPH3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms