Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4GALTQ9NPC4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms