Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB9BQ9NP90 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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