Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms