Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-5Q9HDB9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms