Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR55Q9H6Y2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms