Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3Q9H299 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3Q9H299 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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