Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms