Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms