Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms